日本建設部官員川村康宏在職期間被認為大量搜集美國方面的機密，為防止對本國構成危害，美國方面派遣CIA官員跟蹤川村，時刻準備奪回據說藏有機密的U盤。在行動之初，CIA發現殺手約翰·雷恩（椎名桔平 飾）也介入進來。約翰是美日混血兒，越戰之后受訓成為成為一名獨行殺手，足跡遍布世界各地，成為令美國政府頗為頭痛的人物。當川村步入地下鐵時突遭心臟病身亡，而那支U盤下落不明。在此之后，CIA、日本警察、日本黑幫相繼行動起來，他們共同將目光鎖定在川村的女兒阿綠（長谷川京子 飾）和約翰的身上…… 　　本片根據美國驚悚小說名家貝瑞·艾斯勒（Barry Eisler）的處女作、也是 “殺手約翰·雷恩系列”（assassin John Rain series）的第一部改編。